披针叶野决明基因组调研及SSR特征分析

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【获取途径】超星期刊网
【作者】王金虎，宁琰萍，崔小梅，魏延丽，布多
【作者单位】¹西藏大学生态环境学院；²西藏自治区人民医院呼吸与危重症医学科
【年份】2023
【卷号】第7卷
【期号】第3期
【页码】13-21
【ISSN】2096-4617
【关键词】披针叶野决明高通量测序基因组 SSR分子标记遗传多样性
【摘要】披针叶野决明具有饲用、有机肥料和药用等多重功效。采用Illumina高通量测序技术，借助K-mer分析工具，揭示了披针叶野决明基因组的多个分子遗传学特征，包括基因组大小、杂合度和GC含量等，此外，采用MISA工具进行SSR特征分析，通过NT数据库进行BLAST比对，以探讨其物种多样性。研究结果显示，披针叶野决明的基因组大小为786.16 Mbp，测序深度为61.09×，重复序列比例为59.99%，杂合率为0.60%,GC含量为36.4%。通过对基因组序列进行SSR特征分析，共鉴定了72 357个...
【文献类型】期刊